A la Cabecera Municipal, se puede llegar desde la ciudad de Huehuetenango por carretera asfaltada y un tramo de terracería, que son transitables todo el tiempo. San Pedro Necta dista a 55 kilómetros de la Cabecera Departamental, sobre la ruta interamericana CA-1 que conduce a la Mesilla, del municipio de La Democracia, frontera con México.
Las vías de acceso existentes dentro del Municipio consisten en caminos de terracería que son transitables en época de verano y de malas condiciones en época de invierno, las cuales se complementan con caminos de herradura y veredas como vía para llegar a las comunidades.
