Actualmente funciona un COMUDE, desde donde se discuten y toman decisiones sobre el futuro del municipio. Existe poca participación de la mujer en la decisiónes del COMUDE y en la organizaciones e instituciones.
El municipio de San Miguel Petapa cuenta con buena presencia institucional, entre las cuales se puede mencionar: RENAP, Policía Nacional Civil, Supervisión Educativa, Juzgado de Paz, Registro de Ciudadanos de Tribunal Supremo Electoral –TSE-, entre otros. Como en el cuadro siguiente:
En el cuadro anterior según el taller de mapeo participativo existen seis instituciones representativas en donde laboran 120 personas, las cuales están ubicadas la mayoría en la cabecera municipal y en Villa Hermosa.
En cuanto a ONG que laboran dentro del municipio se encuentran las siguientes:
Según el cuadro anterior en el municipio existen cinco ONG las cuales están ubicadas en el casco urbano y Villa Hermosa, para apoyo a los lugares más poblados en el municipio, la mayoría está basada en el tema de transporte.
