El Municipio, se ubica a 18 kilómetros de la cabecera departamental y a 495 de la ciudad capital. La ruta de acceso de la ciudad capital al Municipio y el área central urbana, está asfaltada, los demás centros poblados tienen carretera de terracería, mismas que por el uso necesitan frecuentemente mantenimiento. En la tabla 8, se describe la situación de las vías de acceso.
En el interior del Municipio las vías de acceso a los centros poblados la mayoría son de terracería y algunos han sido mejoradas con balastro, aunque en menor porcentaje, se observaron algunas rutas sin ningún mantenimiento, principalmente en los caminos hacia las comunidades más lejanas, tales como cooperativa Nueva Guatemala Tecún Umán, caserío San Martín Las Flores y San Valentín Las Flores.
Las autoridades municipales, según la disponibilidad de recursos, invierten en mejoras y mantenimiento de los caminos, para evitar hundimientos y zanjones que puedan afectar la movilidad de los pobladores, especialmente en época de lluvia, los pobladores también colaboran con reparaciones, beneficiando a los productores para el traslado de su producción hacia los mercados o bien a los mayoristas que ingresan con camiones.
Dentro de las vías de acceso pavimentadas, se observaron dos tipos: flexibles ó asfaltadas y rígidas, que son fundidas con concreto de alta resistencia. Por lo general, las rutas principales son asfaltadas, las cuales requieren de mantenimiento constante debido al alto flujo de transporte pesado; mientras que en los pocos caminos que se ubican dentro de los centros poblados y que comunican uno con otro, la Municipalidad ha invertido en pavimentos de concreto, lo cual le da larga vida útil a las vías de comunicación y acceso, esto también permite que el mantenimiento a las mismas se pueda realizar a un largo plazo y así poder invertir recursos en otras mejoras municipales o de interés social.
Como se observa en el mapa anterior, las vías de acceso a lo interno del Municipio, están sin pavimentar, situación que no permite un desplazamiento adecuado de los vehículos que transportan productos para comercializar.
Puentes
Se pudo observar que, para acceder al Municipio, no es necesario construir puentes. En el caserío Eben-Ezer, los habitantes no cuentan con caminos adecuados para vehículos o camiones dentro de la comunidad y derivado de la falta de drenajes, excavaron quebradas para evitar inundaciones e instalaron rampas de madera; esto por la falta de recursos para la infraestructura.
Transporte
Con base en la investigación de campo, se determinó que existen dos empresas de transporte desde la ciudad capital hacia Santa Elena, mismas que hacen varias paradas y se abordan en la terminal de microbuses, y el único bus directo de la capital hacia el Municipio, y viceversa es Fuentes del Norte. A lo interno de San Francisco, se tienen microbuses particulares, autorizados por la municipalidad, con tarifas de Q. 5.00 a Q. 10.00, y se tiene facilidad para llevar producción agrícola hacia el mercado de Santa Elena. Asimismo, en el área central, se observó la circulación de tuc-tuc, hacia barrios cercanos, que cobran una tarifa de Q. 5.00.
